Un escenario (stage en inglés) es el lugar donde se dan los combates entre los personajes. En Project M hay 43 escenarios diferentes, once de los cuales se han mantenido exactamente iguales, catorce han recibido ligeras modificaciones (ya sea en algún carácter específico o por la música de este), cinco han sufrido grandes cambios respecto a sus originiales, diez son procedentes de juegos anteriores (sustituyendo por completo algunos de los escenarios existentes en el original) y tres son completamente nuevos (también sustituyendo escenarios originales).
A partir de la versión 3.6, es posible acceder a una versión alternativa de los escenarios si se mantiene presionado el botón L a la hora de seleccionar el escenario. Los escenarios conocidos hasta el momento se mostrarán a continuación en un subapartado del escenario al que corresponde.
Los escenarios presentes en el mod son los siguientes:
Originales de Project M
- Altárea
- Castillo de Drácula (sustituido a partir de la versión 3.6)
- Secreto Delfino
- Sala de entrenamiento
Originales de SSBB o ligeramente modificados
- Barco Pirata
- Big Blue
- Brinstar
- Campo de Batalla
- Campo de Batalla (versión de SSBM)
- Castillo Asediado
- Corneria
- Fragata Orpheon
- Hal Abarda
- Isla de Yoshi
- Isla Shadow Moses
- Jungla Jocosa
- Norfair
- Onett
- Pictochat
- Port Town Aero Dive
- Pueblo Smash
- Rainbow Ride
- Reino del Cielo
- Sistema Lylat
- Templo
- Warioware
- Zona Extraplana 2
Originales modificados
- Estadio Pokémon 2
- Estadio Pokémon
- La gran cascada
- Planeta Remoto
- Planeta Remoto (sin modificar)
- Zona Green Hill
- Zona Green Hill (sin modificar)
- Hanenbow
Escenarios del pasado añadidos
- Destino final (SSBM)
- Dream Land (SSB) (versión remasterizada)
- Dream Land (SSB) (original)
- Castillo de Hyrule (SSB) (versión remasterizada)
- Castillo de Peach (SSBM) (versión remasterizada)
- Ciudad Azafrán (SSBM) (versión remasterizada)
- Fourside (SSBM)
- Fuente de los Sueños (SSBM)
- Jungla Kongo (SSB)
- Meta Kurisutaru (SSB) (versión remasterizada)
- Yoshi's Story (SSBM)
- Glaciar infinito (SSBM) (muy modificado respecto al original)
- La Cúspide